Článek v druhém kole recenzního řízení.

Afiliace projektu GAUK nebyla uvedena, ale článek vznikl za podpory projektu. Databáze beta-tubulinových sekvencí pro všechny uznávané druhy Aspergillus byla "očištěna" od paralogu tubC a nahrazena genem benA (pokud byla sekvence k dispozici).

Rod Auxarthron (Onygenales) je rod keratinofilních hub, jehož zástupci byli dosud považováni za nepatogenní pro člověka. Tato publikace popisuje vůbec první případ infekce u člověka, která byla navíc způsoben prozatím nepopsaným druhem tohoto rodu. Byly prezentovány celkem čtyři případy, kdy byli zástupci rodu Auxarthron izolováni ze suspektní nebo prokázané onychomykózy a byly stanoveny citlivosti izolátů k antimykotikům. Druh A. ostraviense sp. nov. byl popsán na základě morfologie, fyziologie a molekulárně genetických dat (beta-tubulin, RPB2 a rDNA), která jej jasně odlišila od druhů v minulosti popsaných. Také byl vytvořen dichotomický určovací klíč ke všem zástupcům rodu.

Dva nové druhy rodu Aspergillus v sekci Fumigati byly popsány a pojmenovány po významných osobnostech světové mikrobiologie, které tyto druhy v minulosti izolovaly a uložily do sbírek mikroorganismů. K vymezení druhů byly použity následující metody: fylogenetická analýza založená na pěti nezávislých genetických markerech (včetně beta-tubulinu), spektrum produkovaných sekundárních metabolitů, mikro- a makromorfologie (i skenová elektronová mikroskopie) a fyziologie.

Byla revidována taxonomie komplexu druhů Aspegillus viridinutans, jehož zástupci působí infekce člověka a obratlovců. Na základě molekulárně-genetických dat (beta-tubulin a kalmodulin) a cílenými křížícími pokusy se podařilo vymezit hranice druhů. U některých druhů bylo poprvé pozorováno pohlavní stádium, které nese znaky použitelné k rozlišení druhů. Publikace zahrnuje popis celkem tří nových druhů. Článek je zatím dostupný v online verzi: DOI 10.1007/s13225-013-0262-5

Nepopsaný geofilní druh rodu Microsporum byl izolován z případu tinea corporis u českého pacienta. Pomocí molekulárně genetických (beta-tubulin a ITS rDNA), morfologických a fyziologických znaků se podařilo tento druh odlišit od všech dosuch popsaných druhů v komplexu Microsporum gypseum. Článek byl přijat do tisku, je očekávána proofs verze.

Identifikace klinických izolátů Aspergillus ze sekce Candidi pocházejících z českých pacientů byla revidována za použití sekvenačních dat (geny kódující beta-tubulin a kalmodulin). Mezi těmito izoláty byly zjištěny tři druhy, včetně jednoho nepopsaného druhu. U všech klinických izolátů byly také testovány citlivosti k běžným antimykotikům, které ukázaly všeobecně dobrou citlivost těchto druhů. Fylogenetická analýza, unikátní morfologicko-fyziologické znaky a spektrum sekundárních metabolitů podpořily objevení nepopsaného druhu, který byl pojmenován A. pragensis podle místa izolace obou kmenů. Také bylo demonstrováno, že případy invazivních infekcí způsobene izoláty, morfologicky určenými jako A. candidus podle bílé sporulace, byly ve skutečnosti působeny bíle sporulujícími mutanty jiných druhů. Článek je v recenzním řízení.

Sekce Aspergillus rodu Aspergillus (dříve druhy Eurotium) zahrnuje ekonomicky významné, xerofilní druhy, které jsou široce rozšířené v přírodě a na řadě substrátů spojených s lidskou činností a podílí se na znehodnocování potravin. Tyto druhy jsou známé pro svou schopnost růst na substrátech vykazujících nízkou vodní aktivitu. Vysoká fenoplasticita a častý výskyt atypických izolátů se v minulosti podílely na nadměrném popisování nových druhů v sekci Aspergillus. V této monografii byly druhy podrobeny revizi za použití přístupu kombinujícího sekvenční data ze čtyř nezávislých lokusů (beta-tubulin, kalmodulin, RPB2 a rDNA), PCR-fingerprinting, mikro- a makromomorfologická data a fyziologii. Za použití tohoto přístupu byl celkový počet druhů redukován na sedmnáct. Popis A. proliferans byl doplněn o popis jeho teleomorfy a tento druh se zdá být relativně běžně rozšířeným a často zaměňovaným za A. glaucus. Zeleně sporulující kmeny A. niveoglaucus izolované z potravin a dalších substrátů jsou morfologicky nerozlišitelné od A. glaucus a jsou s ním pravděpodobně také často zaměňovány. V reakci na aktuální změny v botanickém kódu jsme převedli všechny druhy Eurotium do rodu Aspergillus a navrhli jediné platné jméno pro každý druh. Neo-, lekto-, či epityp byl nově označen pro některé revidované druhy.

Druhy rodu Trichophyton jsou klinicky významní původci dermatomykóz člověka a zvířat. Nový druh tohoto rodu byl popsán z případu suspektní onychomykózy u českého pacienta. K popisy byly využity znaky morfologické, fyziologické a molekulárně genetické (beta-tubulin, rDNA, RPB2, aktin). Článek je zatím dostupný v online verzi: doi: 10.1093/mmy/myt010

Článek byl přijatý v přiložené verzi, korektury ještě neproběhly a stránkování není definitivní.

Článek byl přijatý v přiložené verzi, korektury ještě neproběhly a stránkování není definitivní.

Članek je dostupný v tzv. "online first" verzi (DOI 10.1099/ijs.0.047076-0), nemá ještě definitivní stránkování. V příloze je verze obdržená při korekturách (ne definitivní).