• Facebook
  • Twitter
  • RSS
  • Navigator
  • Test2
  • test projekty gauk

test projekty gauk

Výsledky projektu Konstrukce fyzické mapy vazebně nemapovaných oblastí genomu Xenopus tropicalis

Výsledky

▼▲Typ výsledku ▼▲Autor celku ▼▲Název celku
(Celkem 4 zázn.)
Bewick AJ, Chain FJ, Zimmerman LB, Sesay A, Gilchrist MJ, Owens ND, Seifertova E, Krylov V, Macha J, Tlapakova T, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Evans BJ. A large pseudoautosomal region on the sex chromosomes of the frog Silurana tropicalis. Genome Biology and Evolution, 2013, sv. 2013:5, s. 1087–1098. ISSN 1759-6653. IF 4.759. [Článek v časopise]
Jedná se o spoluautorský článek využívající data ze sekvenace krátkého raménka chromozómu 7. Z našeho výzkumu vyplývá, že si jsou pohlavní chromozómy u druhu X. tropicalis velmi podobné a oblast určující pohlaví je velmi malá. Technikou RAD tags se nám nepodařilo nalézt mezi pohlavími významné rozdíly a na samčím (heterogametním) pohlaví se nenacházely pouze dva ze dvaceti scaffoldů se silnou vazbou na pohlaví, které byly identifikovány ve studii (Olmstead et al., 2010). Pravděpodobně to způsobeno nezměněnou rekombinací nebo mnohonásobnou změnou pohlavních chromozómů.
Seifertova E, Zimmerman LB, Gilchrist MJ, Macha J, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Owens ND, Sesay AK, Tlapakova T, Krylov V. Efficient high-throughput sequencing of a laser microdissected chromosome arm. BMC Genomics, 2013, sv. 14, s. 357–357. ISSN 1471-2164. IF 4.40. [Článek v časopise]
Jedná se o prvoautorský článek, ve kterém je jako zdroj financí uveden tento grant. Článek vznikl ve spolupráci s brněnským Veterinárním institutem, kde byla vyřezána krátká raménka chr.7, a britským výzkumným centrem NIMR, ve kterém byl získaný genetický materiál osekvenován metodou Illumina. Bioinformatickou analýzou dat získaných z pouhých 15 kopií krátkého raménka chr.7 bylo k mikrodisektované oblasti přiřazeno více než 200 skafoldů a u 1/3 dříve namapovaných skafoldů bylo zjištěno špatné sestavení. Nově vyvinutý přístup má navíc velmi malé nároky na množství vstupního materiálu, což zcela jistě umožňuje její využití i v dalších oblastech výzkumu či klinické medicíny.
Seifertová, Eva, Spoluautorský článek v recenzním řízení [Jiný výsledek]
Seifertová, Eva, Prvoautorský článek v recenzním řízení [Jiný výsledek]
Poslední změna: 31. květen 2022 14:50 
Sdílet na: Facebook Sdílet na: Twitter
Sdílet na: