  Typ výsledku
Autor celku
Název celku(Celkem 11 zázn.)
|
|---|
| Ottová, Pavla; Espinoza-Herrera, Shirly Josefina; Štěpánek, Josef. Magnesium Effect on Premelting Transitions in Nucleic Acids: DNA Duplex and RNA Hairpin Models. Journal of Molecular Structure, 2010, sv. doi:10.1016/j.molstruc.2010.12.025, s. 1–4. ISSN 0022-2860. IF 1.551. [Článek v časopise] V článku jsou prezentovány výsledky studie vlivu hořečnatých iontů na konformační změny TAR vlásenky, které nastávají v teplotní oblasti pod teplotou tání, při které se struktura vlásenky rozpadá. Vliv hořčíku byl demonstrován na diferenčních spektrech Ramanova rozptylu. Výsledky ukazují, že hořečnaté ionty ovlivňují teplotně indukované změny v oblasti pod teplotou tání. Vliv spočívá v podpoře strukturních změn díky efektivnímu elektrostatickému stínění. Vedle toho se článek zabývá působením hořečnatých iontů na premelting přechod u další struktury nukleové kyseliny. Jedná se o systém poly(dA)-poly(dT), který vytváří duplexovou strukturu. Bylo ukázáno, že hořečnaté ionty se váží na duplex přímo a jejich vliv je mnohem větší než v případě TAR vlásenky. Dokonce na rozdíl od TAR vlásenky, kde podporují teplotně indukované změny v oblasti pod teplotou tání, v případě duplexu poly(dA)-poly(dT) strukturu v této oblasti stabilizují, tedy působí proti teplotně indukovaným změnám.
|
| Pečínková, Pavla; Bok, Jiří; Štěpánek, Josef, Manuskript odeslaný do Journal of Raman Spectroscopy (IF 2.679). Název: Distinguishing co-existing unimolecular and bimolecular structural forms using joint analysis of Raman and UV absorption data. V manuskriptu je prezentován postup společné termodynamické analýzy dat z Ramanovy spektroskopie a UV absorpce naměřené na modelovém systému pro DIS vlásenku. Díky tomuto postupu jsme schopni rozlišit a termodynamicky charakterizovat jedno- a dvoumolekulární strukturní motivy nukleových kyselin nacházející se v roztoku. Z výsledků fitu jsme sestrojili spektra jednotlivých struktur, spektrální charakteristiky v těchto spektrech velice dobře odpovídají jednotlivým strukturám. [Jiný výsledek] |
| Pečínková, Pavla; Bok, Jiří; Štěpánek, Josef, Poster: Structural Forms of the Apical Part of the Dimerization Initiation Site. 7th ICAVS (International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy) – mezinárodní konference, Kobe (Japonsko), 25. – 30. srpna 2013, Book of Abstracts. [Jiný výsledek] |
| Pečínková, Pavla; Štěpánek, Josef, Poster: Structural stability of the apical part of the dimerization initiation site inside the HIV-1 genome. RNA club 2012 – česká konference s mezinárodní účastí, Praha, 16. listopadu 2012. [Jiný výsledek] |
| Pečínková-Ottová, Pavla; Štěpánek, Josef, Poster: Structural stability of RNA hairpins. 31st EUCMOS (European Congress on Molecular Spectroscopy) – mezinárodní konference, Cluj-Napoca (Rumunsko), 26. – 31. srpna 2012. [Jiný výsledek] |
| Pečínková-Ottová, Pavla; Štěpánek, Josef, Poster: Structural stability of the apical part of the dimerization initiation site from HIV-1 genome. 23rd ICORS (International Conference on Raman Spectroscopy) – mezinárodní konference, Bangalore (Indie), 12. – 17. srpna 2012. [Jiný výsledek] |
| Ottová, Pavla; Espinoza-Herrera, Shirly Josefina; Štěpánek, Josef, Orální prezentace: Structural Stability of Apical TAR Hairpin and its Sensitivity to Magnesium. RNA club 2010 – česká konference s mezinárodní účastí, České Budějovice, 5. listopadu 2010, Book of Abstracts. [Jiný výsledek] |
| Ottová, Pavla; Řezáčová, Barbora; Vachoušek, Jan; Štěpánek, Josef, Orální prezentace (2. 6. 2010): Structural Stability and Complexation with Aptamers of RNA Hairpins in HIV-1 Genome. WDS 2010 (Week of Doctoral Students) – studentská konference, Praha, 1. – 4. června 2010. [Jiný výsledek] |
| Ottová, Pavla; Espinoza-Herrera, Shirly Josefina; Štěpánek, Josef, Poster: Structural stability of the apical parts of TAR and DIS hairpins from HIV-1 genome. RNA club 2011 – česká konference s mezinárodní účastí, Praha, 11. listopadu 2011. [Jiný výsledek] |
| Ottová, Pavla; Espinoza-Herrera, Shirly Josefina; Štěpánek, Josef, Poster: Structural Stability of RNA Hairpins: TAR and DIS. 14th ECSBM (European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules) – mezinárodní konference, Coimbra (Portugalsko), 29. srpna – 3. září 2011. [Jiný výsledek] |
| Ottová, Pavla; Espinoza-Herrera, Shirly Josefina; Řezáčová, Barbora; Vachoušek, Jan; Štěpánek, Josef, Poster: Structural Stability and Complexation with Aptamers of RNA Hairpins in HIV-1 Genome. 30th EUCMOS (European Congress of Molecular Spectroscopy) – mezinárodní konference, Florencie (Itálie), 29. srpna – 3. září 2010, Book of Abstracts, p. 113. [Jiný výsledek] |
